Việc áp dụng hóa đơn điện tử đã mang lại nhiều lợi ích thiết thực cho các thành phần kinh tế, giảm thời gian, chi phí cho doanh nghiệp, hạn chế các hành vi gian lận về hóa đơn; thuận lợi trong việc lưu trữ hóa đơn... Ðặc biệt, việc triển khai hệ thống HÐÐT còn có ý nghĩa quan trọng trong xây dựng cơ sở dữ liệu lớn, góp phần  phát triển chính phủ điện tử, công nghệ số quốc gia.
   Theo đó, đến ngày 1-7-2022, toàn bộ người nộp thuế đang sử dụng hóa đơn theo quy định tại Nghị định 51/CP, sẽ chuyển sang sử dụng hóa đơn điện tử, theo quy định của Luật Quản lý thuế và Nghị định 123/2020/CP. Giai đoạn 1 (từ ngày 21-11-2021) triển khai hóa đơn điện tử tại 6 tỉnh, thành phố (Hà Nội, TP Hồ Chí Minh, Hải Phòng, Quảng Ninh, Bình Ðịnh và Phú Thọ); giai đoạn 2 (từ tháng 4-2022) triển khai tại 57 tỉnh, thành phố còn lại.